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铁氧化菌菌株EEELCW01的基因组分析及砷转化功能

Genomic analysis and arsenic transformation of iron-oxidizing strain EEELCW01

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以从砷污染农田土壤中分离的 1 株铁氧化细菌EEELCW01 为研究对象,对该菌进行全基因组分析,通过GO、KEGG、COG等数据库比对,预测该菌砷相关基因的功能;采用水培试验,验证该菌的砷转化能力.结果表明:菌株EEELCW01 基因组大小为 4714242 bp,具有 2条大小分别为 2065078 bp和 2649164 bp的染色体,GC含量为 55.99%,染色体上有 4588 个CDS,包含 58 个tRNA和 12 个rRNA;COG数据库注释表明该菌基因功能主要集中在氨基酸转运代谢、无机离子转运代谢等过程,GO数据库注释表明该菌主要包含膜组成部分、氧化还原过程和相关酶活性等功能,KEGG注释显示代谢相关的基因占比最高;菌株 EEELCW01 基因组中含有多种与砷代谢相关的基因(arsC、arsH、arsB、arsR、acr3、arrA、arxA和arsM);菌株EEELCW01将As(Ⅴ)还原为As(Ⅲ)的能力强,有氧条件下,3 d时还原率达 40.1%.可见,可利用该菌株促进砷的生物还原,并联合砷超富集植物进行环境砷污染修复.

arseniciron oxidation bacteria(FeOB)arsenic transformationgenome analysisfunction prediction

熊潇然、邹奇、吴川、夏礼兵、潘炜松

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湖南农业大学生物科学技术学院,湖南 长沙 410128

华南师范大学生命科学学院,广东 广州 510006

中南大学冶金与环境学院,湖南 长沙 410083

砷 铁氧化菌 砷转化 基因组分析 功能注释

国家自然科学基金

42177392

2023

10.13331/j.cnki.jhau.2023.04.008

湖南农业大学学报(自然科学版)
湖南农业大学

湖南农业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.868
ISSN：1007-1032
年,卷(期)：2023.49(4)
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