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基于Cyt b序列分析黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代的遗传多样性

Genetic diversity analysis of Pelodiscus sinensis and their hybrid from two geographical populations of using Cyt b sequence

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为了解中华鳖(Pelodiscus sinensis)中黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代的遗传特性,分别对它们的线粒体Cyt b基因测序,并进行遗传多样性分析.结果表明:PCR扩增测序黄沙鳖和日本鳖及其杂交子一代 3 个群体共获得 90 条序列,18 种单倍型;90 个个体的 Cyt b基因碱基 A、T、C、G 平均含量分别为 35.4%、26.0%、27.9%、10.7%,表现出明显的反G偏倚;日本鳖、黄沙鳖和杂交鳖分别有 5、6、10种单倍型,日本鳖与杂交子代有共享的单倍型Hap 8、Hap 9和Hap 16;3个群体的变异主要存在于群体内部,变异比例为 60.8%;3个群体的单倍型多样性为 0.747～0.867,平均核苷酸差异数为 12.922～16.262,核苷酸多样性为 0.00913～0.01151;杂交子一代的单倍型数、单倍型多样性、平均核苷酸差异数、核苷酸多样性均最高,日本鳖的均最低,黄沙鳖、杂交子一代、日本鳖的多态位点数依次降低.可见,杂交子代遗传多样性较高,杂交可提高中华鳖的遗传多样性.

Huangsha population of Pelodiscus sinensisJapanese population of Pelodiscus sinensiscyt b genegenetic diversityhaplotypevariable site

肖何威、胡亚洲、秦溱、徐大建、梁艺馨、刘小燕、王晓清

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湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128

黄沙鳖 日本鳖 Cyt b基因 遗传多样性 单倍型 多态位点

国家重点研发计划湖南省水产产业技术体系建设项目

2018YFD0900200

2023

10.13331/j.cnki.jhau.2023.04.017

湖南农业大学学报(自然科学版)
湖南农业大学

湖南农业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.868
ISSN：1007-1032
年,卷(期)：2023.49(4)
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