摘要
目的 探讨慢性牙周炎(CP)和慢性阻塞性肺疾病(COPD)之间潜在的cross-talk基因、相关通路和转录因子.方法 从GEO数据库下载CP(GSE10334和GSE16134)和COPD(GSE76925)的基因表达谱,进行差异表达分析、功能聚类分析、构建蛋白质相互作用(PPI)网络,通过4种拓扑分析算法和模块划分筛选出核心cross-talk基因,再进行功能聚类分析.结果 GSE10334共筛选出164个差异表达基因(DEG)(119个上调、45个下调);GSE16134共筛选出208个DEG(154个上调、54个下调);GSE76925共筛选出1408个DEG(557个上调、851个下调).PPI网络包括21个节点和20条边.最终筛选出7个核心基因CD79A、FCRLA、CD19、IRF4、CD27、SELL和CXCL13,相关通路为原发性免疫缺陷,B细胞受体信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用.其得分最高的转录因子为IRF4.结论 本研究探索了CP和COPD的潜在共同发病机制,其cross-talk基因、相关通路和转录因子可能为进一步的机制研究提供新思路.
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