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基于线粒体Cytb基因的龙头鱼及其近缘物种分子系统发育研究

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测定了长度为1092bp的龙头鱼(Harpadonnehereus)线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列片段,并分析探讨了龙头鱼及其近缘种分子系统发育关系.研究结果表明,4种碱基平均含量分别为29.9%(胸腺嘧啶T)、31.2%(胞嘧啶C)、22.9%(腺嘌呤A)、16%(鸟嘌呤G).碱基替换多发生在密码子第三位点,且分布呈明显偏倚现象,约占总变异的70.1%.碱基转换数略高于颠换数,二者比值为2.03,碱基替代饱和度检验显示碱基突变率尚未达到饱和.以哲罗鱼和河鳟为外群构建邻接系统发育树分成两支,灯笼鱼科鱼类聚为一支,龙头鱼属和蛇鲻属亲缘关系较近.基于非同义突变率(Ka)和同义突变率(Ks)的选择压力分析结果表明,灯笼鱼目鱼类经历了正选择,这与其在长期进化过程中适应深海栖息环境有关,而龙头鱼属和蛇鲻属不同位点似然比率检验未检测到正选择位点,推测与这两种类群的鱼类分布的水深较浅有关.
Molecular phylogeny of Harpadonnehereus and its close relatives based on mitochondrial Cytb gene

杨天燕、蒋艳琳、郭易佳、朱岚倩、林彦均、郑亦佳、高天翔

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浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022

龙头鱼 灯笼鱼目 Cytb基因 系统发育 选择压力

国家自然科学基金2018年度国家级大学生创新创业训练计划项目浙江海洋大学2016-2017年度人才引进科研基金资助

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2020

海洋湖沼通报
山东海洋湖沼学会

海洋湖沼通报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.464
ISSN:1003-6482
年,卷(期):2020.(6)
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