利用16对多态性微卫星标记对新疆额尔齐斯河干流北湾河段、支流哈巴河以及乌伦古湖拟鲤(Ru-tilus rutilus)3个地理群体的遗传多样性及遗传结构进行了分析.结果显示,16个微卫星位点的平均多态信息含量PIC、期望杂合度H e和等位基因数AN分别为0.9029、0.9168和18.9375,遗传参数均反映出3个群体较高的遗传多样性水平.乌伦古湖群体的遗传多样性水平略低于哈巴河和北湾群体.主成分分析表明,影响乌伦古湖群体与哈巴河和北湾群体间遗传多样性差异的主要因素可能为盐度.遗传分化指数和UPGMA聚类分析显示3个群体间均未发生种群遗传分化.分子变异分析(AMOVA)显示个体间的变异贡献率为88.47%,仅少部分变异来源于群体间(1.83%),表明拟鲤3个群体间的遗传变异水平较低.