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云南中甸地区3个牛种PRNP基因23 bp和12 bp位点的InDel多态性与表达水平

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为了探讨云南中甸地区3个地方牛种(中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛)朊蛋白基因(PRNP)启动子区和第1内含子区2个位点(23 bp和12 bp)的插入/缺失突变与PRNP基因mRNA表达的相关性,采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRNP基因23 bp和12 bp位点进行基因分型,比较各组间2个位点的等位基因及基因型分布是否存在差异,并进一步采用荧光定量PCR检测延髓组织内PRNP基因表达水平,分析基因型与基因表达水平的关系.结果表明:中甸牦牛的23 bp InDel缺失纯合(-/-)基因型频率最高(0.838),插入等位基因频率极低(0.09),中甸犏牛(0.467)和中甸黄牛(0.399)的缺失纯合基因型频率也较高;而在12 bp InDel中,3种牛的插入纯合(+/+)基因型频率很高,缺失等位基因频率较低;中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23-12+为主,频率为0.794和0.444,而中甸黄牛主单倍型为23+12-,频率为0.434.性别、年龄和毛色对3种牛延髓组织中PRNP基因的mRNA表达量无显著影响(P>0.05);3种牛23 bp和12 bp的不同基因型和单倍型之间的mRNA表达量差异均不显著(P>0.05),可能与不同基因型mRNA表达量测定时获得的样品量差异太大有关.研究揭示,23 bp InDel缺失等位基因频率和基因型频率在3种牛中都是最高的,而在12 bp InDel中,缺失等位基因频率和基因型频率均较低,对比以往认为的BSE抗病单倍型23+12+,中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23-12+为主,中甸黄牛以23+12-为主,可通过育种改良筛选,培育对BSE有较高抗病性的群体.
The mRNA Level and Insertion/Deletion(InDel)Polymorphisms of PRNP Gene at 23 bp and 12 bp Loci in Three Native Bovines in Zhongdian Yunnan

和晓明、Sameeullah MEMON、刘兴能、岳丹、邓卫东、席冬梅

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云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明650201

云南农业职业技术学院,云南昆明650031

中甸 PRNP 朊病毒 插入缺失

31860634

2022

家畜生态学报
西北农林科技大学

家畜生态学报

CSTPCD北大核心
影响因子:0.635
ISSN:1673-1182
年,卷(期):2022.43(8)
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