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成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与组成分析

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为探明成年商品猪肠道可培养核心菌群的结构与分布,该研究从3头健康成年商品猪的6个肠段17个肠节段中通过普通培养的方法,共分离筛选出355株可培养核心菌,并进行16S rDNA全序列扩增、测序,通过Mothur软件的OTU聚类及NCBI的在线比对进行分析.结果显示,成年猪肠道中的可培养核心菌群绝大部分属于Proteobacteria和Firmicutes两菌门,其中Escherichia、Bacillus、Proteus 3个菌属丰度最高,占全部检出率的80％;Escherichia coli、Bacillusamyloliquefaciens、Shigella、Bacillus和Proteusmirabilis 5个菌种是广泛分布于商品猪肠道各肠段的共有菌种.菌群的OTU聚类分析结果与NCBI在线比对结果存在明显差别,说明当前单纯的OTU聚类分析并不能完全取代菌群基因数据库的直接比对.
Analysis on The Composition and Distribution of Intestinal Culturable Core Bacteria in Adult Commercial Pigs

田野、蔡淳理、杨大容、李慧、刘宝生

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江西农业大学 动物科学技术学院,江西 南昌 330045

四川农业大学 动物医学院,四川 成都 611130

江西农业大学 兽药研究所,江西 南昌 330045

肠道菌群 成年猪 多样性分析 可培养菌 菌群结构 聚类分析

3136055320202ACBL205009GJJ170256

2022

10.3969/j.issn.1673-1182.2022.10.006

家畜生态学报
西北农林科技大学

家畜生态学报

CSTPCD北大核心
影响因子：0.635
ISSN：1673-1182
年,卷(期)：2022.43(10)
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