摘要
目的:探究hsa-miR-92a-3p在不同人类疾病中的表达差异,利用多种生物信息数据库对hsa-miR-92a-3p的靶基因及对靶基因的生物学功能进行预测分析,构建靶基因集合编码蛋白质间的相互关系网络.方法:通过使用miRDB、TargetScan、Clip-seq、miRWalk四个数据库预测hsa-miR-92a-3p的靶向调控基因,利用venny2.0取交集,最终确定hsa-miR-92a-3p的靶基因集合范围.然后通过string11.5构建所预测靶基因集合编码蛋白质间的相互关系网络图.最后通过DAVID和KOBAS3.0公共数据库对所预测的靶基因交集进行功能富集分析(GO分析)和信号转导通路富集分析(KEGG分析).结果:筛选出192个hsa-miR-92a-3p的靶基因,PTEN、ITPR1、MAPK8、FBXW7、KAT2B、SMAD7为关键靶基因,通过GO分析及KEGG分析,发现这些靶基因显著富集于PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、细胞衰老等信号通路中.结论:初步探索了hsa-miR-92a-3p靶基因调控网络,为进一步深入研究hsa-miR-92a-3p的分子调控机制及成为临床诊断和检测潜在的生物标志物提供理论依据.
基金项目
2021年度福建省中青年教师教育科研项目(科技类)(JAT210474)
2020年厦门医学院自然科学类项目(KPT2020-013)
2021年厦门医学院大学生创新创业训练计划(S202112631014)
维普
万方数据