吉林医学2024,Vol.45Issue(7) :1618-1622.DOI:10.3969/j.issn.1004-0412.2024.07.027

子痫前期差异表达基因的筛选和生物信息学分析

宋红红
吉林医学2024,Vol.45Issue(7) :1618-1622.DOI:10.3969/j.issn.1004-0412.2024.07.027

子痫前期差异表达基因的筛选和生物信息学分析

宋红红1
扫码查看

作者信息

  • 1. 丰县人民医院妇科,江苏 徐州 221700
  • 折叠

摘要

目的:筛选子痫前期胎盘组织差异表达基因并行生物信息学分析,探索子痫前期的发生机制.方法:在基因表达综合数据库中筛选出GSE10588、GSE25906 和GSE74341 三个数据集,GEO2R法筛选出子痫前期组和正常妊娠组胎盘组织的差异表达基因,使用DAVID数据库对其进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过STRING网站及Cytoscape软件构建蛋白质的相互作用(PPI)网络并进行可视化,筛选关键基因.结果:共筛选出 255 个差异表达基因,其中 120 个基因表达上调,135 个基因表达下调.进一步筛选出前 10 个关键基因:RHOA,CXCR4,RPL7A,RPL6,CXCL12,MRPS12,PLEC,MAPK1,DDX5,ITGB1.GO分析显示,在生物学过程组中,基因主要富集于细胞黏附、细胞分化、趋化因子、细胞迁徙等;在细胞组分组中,基因主要富集于黏着斑、外泌体、细胞黏附等;在分子功能组中,基因主要富集于细胞黏附.KEGG通路富集分析提示基因主要富集于白细胞迁徙、趋化因子信号通路、血小板激活、黏着斑等.结论:本研究通过生物信息学方法发现细胞黏附、细胞骨架、外泌体、趋化因子等因素参与子痫前期的发生,为子痫前期发生机制的进一步研究和药物靶点、标志物的筛选提供了基础.

关键词

子痫前期/妊娠期高血压/生物信息学分析/差异表达基因/蛋白质互作网络

引用本文复制引用

出版年

2024
吉林医学
吉林省人民医院

吉林医学

影响因子:0.926
ISSN:1004-0412
段落导航相关论文