摘要
目的 探讨PER2基因在喉癌组织和癌旁非肿瘤组织中的表达水平及其与临床预后之间的相关性.方法 综合利用肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中的GSE84957数据集,分析PER2基因在喉癌患者癌组织及癌旁组织中的表达水平,并利用实时荧光定量PCR法在64例喉癌患者组织中验证PER2基因的表达.同时利用COX回归分析探讨PER2基因表达与喉癌患者临床预后和病理特征的相关性,进一步分析PER2基因的蛋白互作网络及功能富集,初步探索其在喉癌发生发展中的作用机制.结果 基于TCGA和GEO数据库分析结果显示PER2基因在喉癌组织中显著低表达(P＜0.01),PCR结果证实PER2基因在喉癌组织的表达量显著低于癌旁正常组织(P＜0.01).同时PER2基因高表达与喉癌患者的总生存期和无进展生存时间呈现显著正相关,且与喉癌患者的临床分期、分化程度和淋巴结转移状态等临床病理特征显著相关;蛋白互作及功能富集分析显示PER2基因主要通过与时钟相关基因相互作用参与昼夜节律等生物调控过程,从而在喉癌的发生发展中发挥重要作用.结论 PER2基因在喉癌组织中显著低表达且与喉癌患者的良好预后显著相关,其中机制可能是通过与时钟相关基因蛋白互作,进而在调控昼夜节律等过程中发挥重要作用.
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