江苏农业学报2021，Vol.37Issue(4) ：817-822.DOI:10.3969/j.issn.1000-4440.2021.04.001

水稻响应热胁迫核心基因的筛选与鉴定

Screening and identification of core genes responding to heat stress in rice

张斌 杨昕霞 袁志辉
江苏农业学报2021，Vol.37Issue(4) ：817-822.DOI:10.3969/j.issn.1000-4440.2021.04.001
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水稻响应热胁迫核心基因的筛选与鉴定

Screening and identification of core genes responding to heat stress in rice

张斌 1杨昕霞 1袁志辉1
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作者信息

  • 1. 湖南科技学院,湖南 永州 425199
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摘要

基于热胁迫条件下的水稻转录组数据,通过HTSeq和DESeq软件筛选差异表达基因;对其进行功能富集和构建蛋白质互作网络,鉴定最重要模块中的核心基因.结果显示:水稻热胁迫0h、1h、6h和12h条件下,共有278个差异表达基因,生物学过程主要富集在刺激反应和蛋白质折叠上;鉴定出含有12个基因的重要模块.基因表达模式显示重要模块中7个核心基因受热胁迫诱导上调,推测这7个核心基因在水稻响应热胁迫过程中发挥关键作用.

关键词

水稻/高温胁迫/核心基因/转录组

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基金项目

出版年

2021
江苏农业学报
江苏省农业科学院

江苏农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.093
ISSN：1000-4440
被引量2
参考文献量1
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