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铝胁迫下金沙柚3个WRKY基因的生物信息学与表达分析

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WRKY是植物中特有的具有锌指结构的转录因子家族之一,在植物非生物逆境胁迫应答中起着重要的调控作用.为研究金沙柚WRKY在铝胁迫条件下的作用,研究在前期构建的金沙柚铝胁迫转录组数据基础上,利用生物信息学方法从金沙柚根中得到了能显著响应铝胁迫的3个WRKY基因(Cg4g001470、Cg7g003890和Cg6g010690),开放阅读框长度分别为966、933和993 bp,各编码321、310和330个氨基酸,分别命名为CgWRKY40、CgWRKY70-1和CgWRKY70-2,氨基酸序列和结构分析显示,这3个基因编码的蛋白分别属于WRKY蛋白的Ⅱa、Ⅲ a和Ⅲ a类型,PSORT亚细胞定位预测均定位于细胞核.实时荧光定量PCR分析表明,3个WRKY基因在金沙柚的嫩根、老根、茎和叶的表达量存在较大差异,在老根的表达量均最高;在铝胁迫处理后,均能出现不同程度的上调表达,相对表达量分别为处理前的4.58、1.52和12.06倍.在铝胁迫条件下,水杨酸能较大幅度的调控3个WRKY基因的上调表达,分别为对照的133.80、33.39和114.23倍;过氧化氢调控3个WRKY基因出现显著上调表达,分别为对照的86.40倍、7.93倍和102.32倍;水杨酸与过氧化氢共同作用下能调控3个WRKY基因出现不同程度的上调表达,分别为对照的51.81倍、1.51倍、37.72倍.上述研究表明,3个WRKY基因均能参与铝胁迫响应,且均可以被水杨酸、过氧化氢、水杨酸与过氧化氢调控上调表达.
Bioinformatics and Expression Analysis of 3 WRKY under Aluminum Stress in Jinsha Pomelo

刘召亮、万水林、闫承璞、王雨亭、胡钟东

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江西省农业科学院园艺研究所,江西南昌330200

金沙柚 WRKY 生物信息学 表达分析

国家自然科学基金国家国际科技合作专项江西省农科院创新基金江西省农科院创新基金国家柑橘产业技术体系江西省柑橘产业技术体系

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2019

江西农业大学学报
江西农业大学

江西农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.748
ISSN：1000-2286
年,卷(期)：2019.41(1)
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