[目的]尾叶紫薇是培育香花紫薇的重要种质资源,目前花香功能基因的研究及已开发的SSR分子标记较少,无法满足分子育种研究需求.[方法]采用PacBio sequel平台对尾叶紫薇3个开花时期混样进行全长转录组测序,通过公共数据库对Unigene进行功能注释,利用MISA软件检索全长转录组的SSR位点,Primer3批量设计SSR引物并检测.[结果]测序获得39087条非冗余、高质量全长转录本,平均长度为2109 bp,N50长度为2427 bp,长度主要分布在500～4000 bp.有38559条序列(98.64％)获得功能注释,功能主要集中于细胞进程及代谢进程.其中参与花香相关萜类物质合成的有56个,参与脂肪酸衍生物合成的有922个.获得的16425个SSR位点分布在12060条序列中,平均每5.02 kb出现1个SSR序列,3141条序列含有多个SSR位点.SSR位点主要重复类型是二核苷酸和三核苷酸,分别占所有SSR位点的41.95％和31.58％,重复基序类型有96种,AG/CT重复类型的出现频率最高.SSR的重复次数以5～15次为主,长度为10～86 bp,平均为16.84 bp.随机选取52对SSR引物进行PCR检测,有40对引物能产生单一、清晰的条带,有效扩增率为76.92％.[结论]获得与花香物质合成相关基因序列和大量有效SSR标记,将为深入了解尾叶紫薇花香物质合成与代谢、紫薇属植物种质资源评价与保护、分子标记辅助育种等研究奠定基础.
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