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基于TCGA和HADb数据库筛选自噬相关基因在舌癌中的差异表达及对预后的影响

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目的:探讨自噬相关基因(ATG)在舌癌发病机制中的作用,以建立一个基于ATG表达谱的舌癌患者预后预测模型.方法:基于TCGA和HADb数据库,采用Wilcox检验方法确定舌癌中差异表达的ATG,COX回归分析ATG与舌癌患者总生存率的相关性;GO、KEGG分析揭示舌癌中与自噬基因相关的信号通路和生物学过程;评价ATG与舌癌患者临床性状之间的关系.结果:舌癌组织和癌旁组织的ATG具有差异性表达,5个差异基因(VEGFA、ATG9B、WDR45、BAK1、VAMP3)与舌癌患者的总生存率显著相关,可预测患者预后生存;GO、KEGG分析显示多条关键自噬相关通路显著富集,如细胞凋亡、P53信号通路、自噬功能、表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药等;ATG9B、VEGFA、WDR45等ATG与患者不同临床病理特征具有显著相关性.结论:VEGFA、ATG9B、WDR45、BAK1、VAMP3等差异自噬基因可预测舌癌的预后.
Differential expression of autophagy related genes in tongue cancer and its influence on prognosis based on TCGA and HADb database

张凯、张斌、金晗、刘忠爽、李莹

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哈尔滨医科大学附属第二医院硬组织发育与再生研究所,黑龙江 哈尔滨150001

黑龙江省医学科学院,黑龙江 哈尔滨150001

自噬相关基因 舌癌 预后 凋亡 信号通路

国家自然科学基金

81801040

2020

10.3969/j.issn.1674?8603.2020.04.005

口腔生物医学
南京医科大学

口腔生物医学

CSTPCD
影响因子：0.423
ISSN：1674-8603
年,卷(期)：2020.11(4)
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