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基于宏基因组测序的牙周炎患者口腔微生物群落研究

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目的:通过宏基因组方法结合高通量测序技术探究牙周炎患者口腔微生物菌群的组成和功能,及其与牙周炎发生发展的相关性.方法:分别采集10名牙周炎患者的唾液和龈下菌斑样本,并提取各样本中微生物总DNA,构建宏基因组文库,进行MGISEQ⁃2000测序,分别使用Metaphlan2软件、Humann2软件进行生物信息学分析.结果:微生物组成分析结果显示,在属水平上,卟啉单胞菌属在唾液及龈下样本组中的平均相对丰度无统计学差异(P>0.05);普雷沃氏菌属、噬二氧化碳细胞菌属等的相对丰度在两样本组中具有统计学差异(P<0.05).在种水平上,副流感嗜血杆菌、浅黄奈瑟球菌等在两样本组中相对丰度差异具有统计学意义(P<0.05).功能分析结果显示,唾液和龈下菌斑样本中贡献菌和序列的相对丰度具有统计学差异(P<0.05).结论:龈下微生物样本对于牙周炎致病菌方面的研究可能更具代表性,利用宏基因组学研究与牙周炎疾病相关的代谢通路值得进一步发展.
Study on oral microbial community of periodontitis patients based on macrogenomic sequencing

许悦、张宇宸、孙斌、程政、周秦

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西安交通大学口腔医院综合科,陕西 西安710004

西安交通大学口腔医院种植科,陕西 西安710004

同济大学附属口腔医院种植科,上海200072

牙周炎 宏基因组学 高通量测序 口腔微生物

吸烟对种植体周围微生物群落影响的宏基因组学研究

2019SF?144

2020

10.3969/j.issn.1674?8603.2020.04.000

口腔生物医学
南京医科大学

口腔生物医学

CSTPCD
影响因子：0.423
ISSN：1674-8603
年,卷(期)：2020.11(4)
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