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rps12基因在裸子植物中的分子进化式样

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叶绿体rps12基因是所有叶绿体基因中最特殊的,由在基因组上相距甚远的两部分组成,含有3个外显子,经反式剪接作用编码核糖体小亚基S12蛋白.探究该基因的分子进化式样有助于理解该基因的进化过程及基因组特征.应用二代测序技术对南洋杉和柏木的叶绿体基因组进行测序;共选取78种裸子植物和2种蕨类植物,在系统发育背景下结合最大似然法,对rps12基因的进化速率、选择压力和适应性进化进行分析.结果 显示,外显子3发生独立的碱基插入事件,发生插入的序列受到了更强的负选择作用;外显子2～3位于反向重复区,它们的替换率显著低于外显子1,rps12编码序列受到更强的负选择作用;适应性进化分析没有检测到正选择位点.结果 表明,在裸子植物的进化过程中rps12基因结构稳定,并保持着相对较低的进化速率且表现出高度的保守特性;这为反向重复区具有降低的替换率提供了更多的证据,同时也揭示了裸子植物中存在的进化速率异质性现象.
The molecular evolution pattern of rps12 gene in gymnosperms

平晶耀、冯佩沛、郝静、栗锦烨、苏应娟、王艇

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华南农业大学生命科学学院,广州510642

中山大学生命科学学院,广州510275

中山大学深圳研究院,深圳518057

裸子植物 rps12 反向重复区 进化速率 选择压力 适应性进化

31670200317705873187267032071781

2021

10.1360/TB-2020-1528

科学通报
中国科学院国家自然科学基金委员会

科学通报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.269
ISSN：0023-074X
年,卷(期)：2021.66(24)
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