摘要
目的 基于肿瘤研究公共数据库TCGA和GTEx的样本RNASeq数据信息鉴定在胃腺癌中异常表达且与预后相关的关键基因,并探讨其与免疫细胞浸润的相关性,旨在寻找新的诊治靶点.方法 应用GEPIA 2.0可视化肿瘤数据分析平台,对公共数据库中胃腺癌及癌旁组织的差异表达基因和预后相关基因进行分析,并筛选出胃腺癌中差异表达并与预后相关的基因,使用FunRich软件进行GO和KEGG富集分析,通过TIMER 2.0和TISIDB分析关键基因表达与免疫细胞浸润的相关性.结果 共筛选到4644个差异表达基因,包括3746个上调基因和898个下调基因.与胃腺癌总生存期(OS)和无病生存期(DFS)相关的前500个基因中GFRA3、APBB1、ABCA8、PLCXD3、FAM153B、CLRN3、CD300LG及ASF1B 8个基因差异表达.经过进一步验证确定ABCA8、PLCXD3、CLRN3、CD300LG及ASF1B 5个关键基因,ABCA8、PLCXD3和CD300LG在胃腺癌组织低表达,CLRN3和ASF1B在胃腺癌组织高表达(P<0.01);在胃腺癌中ABCA8、PLCXD3和CD300LG低表达患者OS和DFS较长,CLRN3和ASF1B高表达患者OS和DFS较长(P<0.05).相关性分析发现以上5个关键基因表达与免疫细胞浸润水平、丰度具有相关性(P<0.01),且预后风险模型单因素Cox回归分析显示以上5个关键基因是胃腺癌预后的相关风险因素(P<0.05,P<0.01).结论 ABCA8、PLCXD3、CLRN3、CD300LG和ASF1B 5个基因在胃腺癌中异常表达,且与预后相关;其表达与免疫细胞浸润具有相关性,可作为预后风险模型的相关风险因素.
基金项目
部队专项培育面上项目(2021YXKY021)
科技部、财政部惠民计划资助项目(2012GS620101)
维普
万方数据