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基于生物信息学分析受体酪氨酸磷酸酶U对胃癌免疫微环境的影响

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目的 分析TCGA数据库中胃癌数据集,探讨受体酪氨酸磷酸酶U(PTPRU)对胃癌免疫微环境的影响.方法 获取TCGA数据库中胃癌的RNA-seq数据集,共提取33对配对样本.使用R语言的Limma包分析差异基因,并使用CIBERSORT算法评估胃癌样本中的免疫微环境组成.结果 胃癌组织中PTPRU基因表达升高,且与人表皮生长因子受体2(HER-2)基因表达升高具有较高的相关性.通过CIBERSORT算法进一步评估胃癌样本中免疫微环境发现,B细胞、辅助性T细胞及T细胞调节细胞的浸润深度均升高(均P<0.05),单核细胞的浸润深度下降(P<0.05).结论 PTPRU的高表达可能通过抑制微环境中的免疫细胞功能,引起胃癌的发生发展.

宋坤、林云霄、葛祖荫、王天工、邱江峰、郝敬铎

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上海交通大学附属仁济医院

受体酪氨酸磷酸酶U 胃癌 肿瘤免疫微环境

浙江省医药卫生科技计划浙江省医药卫生科技计划

2019KY6262020KY894

2024

现代实用医学
宁波市医学会

现代实用医学

影响因子:0.652
ISSN:1671-0800
年,卷(期):2024.36(3)
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