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马铃薯PAL基因的生物信息学初步分析

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PAL是催化直接脱掉L-苯丙氨酸上的氨而生成反式桂皮酸的酶,是一个可把苯丙氨酸用于酚类化合物合成的酶.本文利用电子克隆技术获得一个马铃薯PAL基因的cDNA序列,运用多种生物信息学方法对其进行初步分析.从核酸序列到氨基酸序列,再到蛋白质的高级结构预测,获得了该基因的电子克隆全长.结果表明:该序列全长2529bp,共编码722个氨基酸,有多个限制性酶切位点,有38个磷酸化位点,属于亲水性氨基酸,无信号肽,无膜穿透性,无保守结构域.文末对下一步的实验验证和功能分析进行了展望,为进一步研究该基因在马铃薯特别是在抗病性的功能提供相关依据.
Bioinformatics Analysis of pal Gene in Potato

常燕楠、刘洁、梁金太

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山西省临汾市山西师范大学生命科学学院 041000

山西省临汾市园林事业局 041004

马铃薯 PAL 生物信息学

国家自然科学基金

NSFC31271774/31771858

2018

现代农业研究
黑龙江省科学技术情报研究所

现代农业研究

影响因子:0.166
ISSN:2096-1073
年,卷(期):2018.(6)
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