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RNA-Seq定量分析盐肤木对铅胁迫的响应

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为探究重金属污染地生态修复先锋植物——盐肤木对重金属胁迫的分子响应机制,设置3个铅胁迫水平(0、250、1000 mg·kg-1),应用Illumina HiSeqTM 2000进行盐肤木根系的转录组测序,并通过Gene Ontology(GO)与Pathway功能显著富集分析方法,分析说明盐肤木响应不同铅胁迫水平下的差异表达基因.结果表明,盐肤木在遭受轻度铅胁迫时,主要有4类水解酶与2类磷酸酶相关基因显著富集,说明盐肤木主要通过调节细胞内水解酶与磷酸酶相关基因来抵御胁迫,而在重度铅胁迫下,主要有6类氧化还原酶相关基因出现显著富集,此时氧化还原酶相关基因起到主要调节作用;盐肤木在铅胁迫下细胞受损,在轻、重度铅胁迫下,分别有24、16类细胞相关基因显著富集,但其自身可通过调节细胞内细胞器、细胞质等相关的细胞运动以应对逆境;核糖体代谢通路是盐肤木适应铅胁迫的主要代谢通路.研究表明,核糖体相关基因是盐肤木响应铅胁迫的主要应答与调节基因.
Molecular responses of Rhus chinensis to lead stress revealed by RNA-Seq

夏丽丹、张虹、胡华英、曹升、周垂帆

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福建农林大学林学院,福州 350002

海峡两岸水土保持协同创新中心,福州 350002

福建长汀红壤丘陵生态系统国家定位观测研究站,福州 350002

盐肤木 铅胁迫 核糖体 RNA-Seq

福建省环保科技计划项目福建农林大学科技创新专项基金福建农林大学科技创新专项基金

2018R012CXZX2018137CXZX2018132

2019

10.11654/jaes.2018-1571

农业环境科学学报
农业部环境保护科研监测所 中国农业生态环境保护协会

农业环境科学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.52
ISSN：1672-2043
年,卷(期)：2019.38(7)
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