在实体论上,方以智接受了传统理学的立场,认为世界不仅理气辨为二分,且统为一体.这便是实体的真谛.方以智用"三以"来概括实体,认为实体分为"可以""何以"以及"所以"."可以"对应气世界,"何以"对应理世界,"所以"对应理气合一的实体.在此基础上,方以智更关注对原因的追问,并提出"公因反因说".理、气之间既是相对立的"反因",又是关联的"相因",合起来便是"公因".方以智进一步将其"因论"发展为范畴说,认为反因和公因的分别又是反因,合一则是公因,从而形成了一种近似于辩证法的思维方式,即矛盾对立之统一.这表明方以智哲学关注的重心从传统实体论转向关注思维方式的知识论上,并成为其哲学的新亮点.
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