中华肿瘤防治杂志2020,Vol.27Issue(3) :193-201.

肺腺癌CASZ1表达临床意义GEO及TCGA数据库资料分析

Analysis of the expression and clinical significance of CASZ1 in lung adenocarcinoma based on GEO and TCGA databases

刘盈 黄凤祥 孙盼锋 彭强 赵畅 苗丽君
中华肿瘤防治杂志2020,Vol.27Issue(3) :193-201.

肺腺癌CASZ1表达临床意义GEO及TCGA数据库资料分析

Analysis of the expression and clinical significance of CASZ1 in lung adenocarcinoma based on GEO and TCGA databases

刘盈 1黄凤祥 1孙盼锋 2彭强 1赵畅 1苗丽君1
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作者信息

  • 1. 郑州大学第一附属医院呼吸与危重症医学科,河南郑州450052
  • 2. 河南大学淮河医院呼吸与危重症医学科,河南开封475000
  • 折叠

摘要

目的 CASZ1在多种肿瘤中异常表达,并参与肿瘤的发生发展,但其在肺腺癌中的表达及临床意义罕见报道.本研究旨在探讨CASZ1表达水平与肺腺癌临床病理特征和预后的关系.方法 通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库探讨CASZ1在33种肿瘤中的表达情况.通过基因表达综合(Gene Expressi on Omnibus,GEO)数据库及癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得CASZ1在肺腺癌中的表达数据及相关病理参数,分析CASZ1表达水平与肺腺癌患者临床病理特征和总生存期(overall survival,OS)的关系,并通过免疫组化验证CASZ1蛋白在肺腺癌中的表达.通过TCGA数据库获得CASZ1在肺腺癌中的甲基化水平,分析肺腺癌中CASZ1表达失调的可能机制.采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测CASZ1相关的基因通路.结果 GEPIA数据库分析结果显示,与正常组织相比,在11种肿瘤中CASZ1表达水平下调,在2种肿瘤中表达上调.在TCGA及GSE43458、GSE118370和GSE10072既往吸烟、吸烟及从未吸烟数据集中,CASZ1表达水平在肺腺癌组织中均下调,差异有统计学意义,均P<0.001.免疫组化结果提示,CASZ1蛋白在肺腺癌组织中表达也下调,t=5.969,P<0.001.TCGA及GSE68465数据集结果提示,CASZ1基因低表达组预后差于高表达组(x2=6.923,P=0.009;x2 =11.175,P=0.001).在肺腺癌组织中,CASZ1表达水平与6个甲基化位点(cg01551133、cg08885197、cg20288000、cg14170597、cg22728186和cg20329303)关联(P<0.001),其中cg01551133、cg14170597和cg22728186高甲基化组生存期短于低甲基化水平组(x2=11.290,P=0.001;x2=12.901,P<0.001;x2=7.083,P=0.008).GSEA结果提示,CASZ1低表达样本富集在G2M检查点(P<0.001,FDR<0.001)、E2F信号通路(P<0.001,FDR<0.001)等基因集.结论 肺腺癌中CASZ1表达水平下调,其甲基化水平升高可能是CASZ1失调的潜在机制,CASZ1低表达提示肺腺癌患者的预后差,可作为肺腺癌患者治疗的潜在靶点.

关键词

肺腺癌/CASZ1/基因表达综合数据库/癌症和肿瘤基因图谱/甲基化

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基金项目

河南省科技厅攻关项目(162102310196:)

河南省卫生科技创新人才工程(4088)

出版年

2020
中华肿瘤防治杂志
中华预防医学会 山东省肿瘤防治研究院

中华肿瘤防治杂志

CSTPCD北大核心
影响因子:1.292
ISSN:1673-5269
被引量1
参考文献量4
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