摘要
采用全长转录组文库结合三代高通量测序的方法得到远海梭子蟹Sox9基因的全长序列,通过引物设计及PCR产物直接测序验证三代测序结果,最终准确地获得Sox9基因序列.对Sox9基因全长序列进行生物信息学及基因进化分析.结果表明该基因CDS基因序列全长1461bp,蛋白质的无规则卷曲、α-螺旋、β-折叠区域分别占58.64％、25.93％、0％.进化树分析结果表明,远海梭子蟹Sox9与三疣梭子蟹的Sox10基因同源性较高,其核酸序列和氨基酸序列的相似性分别为96.24％和98.77％.远海梭子蟹的Sox9基因鉴定和蛋白质结构预测与功能分析,将为该物种遗传资源挖掘与利用分析奠定重要基础.
基金项目
贵州省大学生创新项目(S2021106660)
贵州省科技厅基础研究项目(黔科合基础[2018]1166)
黔西南州科技计划()
兴义民族师范学院州管专家项目(21XYZJ02)
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