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木珊瑚科Cladopsammia gracilis和Rhizopsammia wettsteini线粒体全基因组比较与系统进化分析

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木珊瑚科(Dendrophylliidae)下的枝沙珊瑚属(Cladopsammia)和 Rhizopsammia属的物种分类目前仍存在模糊的界定,本研究结合形态特征与微观结构和线粒体全基因组测序对 Cladopsammia gracilis与 Rhizopsammia wettsteini进行形态和分子进化水平的分析比较.结果显示:形态学特征上,R.wettsteini通过生殖根出芽,珊瑚肋上具有小尖状突起,隔片薄而脆;而C.gracilis则无生殖根,珊瑚肋上突起为细瘤状,隔片颗粒感强且较厚.两个物种的线粒体基因组组成十分相似,同样包含 13个蛋白编码基因、2个rRNA基因和 2个tRNA基因,与大部分六放珊瑚相同;在基因重叠情况和密码子偏好性上则有别于大部分六放珊瑚.基于 CO1 基因的系统进化分析显示,C.gracilis和 R.wettsteini关系较近,却与枝沙珊瑚属(Cladopsammia)其他物种关系较远,因此C.gracilis是否归入枝沙珊瑚属(Cladopsammia)值得探讨,同时提示我们需要重新审视枝沙珊瑚属(Cladopsammia)的分类地位.
Complete mitochondrial genome of Cladopsammia gracilis and Rhizopsammia wettsteini(Scleractinia,Dendrophylliidae)and its phylogenetic implications
There is a taxonomic uncertainty on the species classification of Cladopsammia gracilis and Rhizopsammia wettsteini as well as the unresolved status of the closely related genera Cladopsammia and Rhizopsammia.In order to further analyze the phylogenetic relationship between C.gracilis and R.wettsteini,we examined the micromorphological and microstructural features and systematically compared the gene structure,genetic distance and codon preference of two mitochondrial genomes.The results show that there are three distinct characteristics:reptoid budding,costae and septa.The genome composition of the two species is very similar,containing 13 protein-coding genes,2 rRNA genes and 2 tRNA genes.Unlike most scleractinians,there were no overlaps between genes.In addition,phylogenetic analysis based on CO1 genes show that C.gracilis and R.wettsteini are closely related but distantly related to other species of the genera Cladopsammia.The present study highlights the need for an integrative approach to conduct a deeper species delimitation of genera Cladopsammia and Rhizopsammia.

Dendrophylliidaemitochondrial genomestaxonomyphylogenetic analysis

霍嘉欣、李颖心、宋严、朱晴、周伟华、袁翔城、黄晖、刘胜

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中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室,广东省应用海洋生物学重点实验室,中国科学院南海海洋研究所,广东广州 510301

三亚海洋科学综合(联合)实验室,海南省热带海洋生物技术重点实验室,海南 三亚 572000

海南三亚海洋生态系统国家野外科学观测研究站,中国科学院海南热带海洋生物实验站,海南 三亚 572000

中国科学院大学,北京 100049

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木珊瑚科 线粒体基因组 分类学 进化分析

广东省基础与应用基础研究基金海南省重点研发计划国家重点研发计划

2022A1515010656ZDYF20202002021YFF0502800

2024

热带海洋学报
中国科学院南海海洋研究所

热带海洋学报

CSTPCD北大核心
影响因子:0.513
ISSN:1009-5470
年,卷(期):2024.43(3)