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三裂叶薯NBS-LRR类抗病基因的筛选鉴定与结构分析

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为发掘甘薯近缘野生种三裂叶薯(Ipomoea triloba)的NBS-LRR类抗病基因,从基因数据库中对三裂叶薯基因组序列进行了筛选、鉴定和分析.结果 表明,从三裂叶薯的98025个基因中,筛选到282个编码NBS-LRR类蛋白的基因,其中N型80个,NL型83个,CN型28个,CNL型57个,TN型10个,TNL型23个,RN型1个.三裂叶薯的16条染色体上均含有NBS-LRR家族基因,数量最多的染色体含有65个,最少的只有1个.三裂叶薯基因组共有55个基因簇,包含了63.5％的NBS-LRR家族基因.在NBS-LRR抗病基因家族中,CNL和TNL亚家族分别对应到7和11个保守结构域.这为三裂叶薯抗性资源的利用提供了科学参考.
Screening and Identification and Structural Analysis of NBS-LRR Family Genes in Ipomoea triloba

胡韵卓、石媛媛、黄小芳、毕楚韵、周丽香、梁才晓、黄碧芳、许明、林世强、陈选阳

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福建农林大学, 作物生物技术福建省高校重点实验室,福州 350002

福建农林大学, 植物保护学院,福州 350002

福建农林大学,农学院,福州 350002

福建农林大学, 生命科学学院,福州 350002

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三裂叶薯 NBS-LRR R基因 结构域 染色体定位 进化树

福建省科技重大专项福建省科技重大专项福建农林大学科技创新平台项目

2017NZ0002-2闽农种函[2019]478号PTJH12015

2020

10.11926/jtsb.4184

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2020.28(5)
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