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东乡野生稻苗期响应低温胁迫的转录组分析

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为了解东乡野生稻(Oryza rufipogon)对低温胁迫的响应机制,对苗期的RNA-seq转录表达谱进行了研究.结果表明,与对照相比,共检测到10200个差异表达基因(DEGs),其中5201个上调表达,4999个下调表达,其中有426个DEGs位于已报道的水稻耐冷QTL区间,且37个为耐冷调控相关的家族基因.GO功能分类和KEGG代谢路径分析表明,核酸结合转录因子活性、氨基酸生物合成以及光合作用代谢等均参与响应低温胁迫过程.实时荧光定量分析表明,ABA响应蛋白基因、MYB转录因子和40S核糖体蛋白SA基因等12个可能与低温胁迫响应相关的DEGs表达模式与RNA-seq的一致.可见,植物激素传导途径和转录因子相关调控基因在东乡野生稻苗期响应低温胁迫过程中起重要作用.
Transcriptome Analysis of Response to Low Temperature Stress in Dongxiang Wild Rice at Seedling Stage

白李唯丹、戴亮芳、陈雅玲、张帆涛、谢建坤、罗向东

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江西师范大学 生命科学学院,南昌330022

东乡野生稻 低温胁迫 转录组学 耐冷基因

国家自然科学基金国家自然科学基金江西省自然科学基金重点项目江西省主要学科学术和技术带头人培养计划项目

316603843206007420202ACB20500120204BCJ22024

2021

10.11926/jtsb.4387

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2021.29(6)
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