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碎米荠超氧化物歧化酶基因家族成员的鉴定和分析

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为了解碎米荠(Cardamine hirsuta)的SOD基因特征,对SOD家族成员的基因结构、染色体定位、系统进化关系进行了分析,对顺式作用元件和蛋白结构进行了预测,并利用qRT-PCR技术检测各家族成员的组织表达模式.结果表明,碎米荠基因组中共有10个SOD基因(ChSODs),包括6个Cu/Zn-SOD、3个Fe-SOD和1个Mn-SOD.编码的ChSODs蛋白有57～324个氨基酸,分子量为6419.41～34659.01 kDa,理论等电点为4.92～9.60;系统进化树分析表明,碎米荠的ChSOD与拟南芥的AtSOD的同源性较高;ChSODs在根、茎、叶中均有表达,且在叶中高表达,其中CARHR085500和CARHR256690在叶和茎中表达量较高;顺式作用元件预测表明,碎米荠SOD响应多种非生物胁迫,其中对ABA和低温胁迫较为敏感;ChSODs蛋白质的二级和三级结构具有差异性.这表明碎米荠SOD基因在抗氧化过程中发挥重要作用.
Identification and Analysis of Superoxide Dismutase Gene Family Members of Cardamine hirsuta

付伟、李林、康宇、龙澜、杨永康、殷红清、向极钎、梅磊

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恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000

湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000

中国科学院植物研究所,北京 100093

碎米荠 SOD 基因家族

硒蛋白产业化关键技术研究与应用项目湖北省引进国外人才和智力项目

12602-2-1202020BJH024

2022

10.11926/jtsb.4476

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2022.30(3)
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