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基于RAD高通量测序的蓝花楹群体遗传分析

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为了解蓝花楹(Jacaranda mimosifolia)种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对168份种质材料进行RAD-seq测序,构建了系统进化树并进行主成分、群体结构和遗传多样性分析.结果表明,比对参考基因组平均比对率为81.02％,平均测序深度23.18×,最终获得45552个高质量的SNPs.群体遗传结构分析表明,供试蓝花楹可划分为2个大的类群,来自川、渝地区的种质材料基本归为一类;其余地区归为另一类.19个地区的蓝花楹在SNP水平上的遗传多样性较高,云南昆明(YNKM)居群的核苷酸多样性(π)和期望杂合度(He)最大,表现出最高的遗传多样性.因此,来自川、渝地区的蓝花楹具有相对较近的亲缘关系,推断来自同一祖先,而其余地区的种质可能是随机引种栽培.
Population Genetic Analysis of Jacaranda mimosifolia by RAD Hight Throughput Sequencing Technique

刘学锋、李小梅、张国武、张沛健、刘果、黄敏、陈银霞

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中国林业科学研究院速生树木研究所,广东 湛江 524022

湛江科技学院,广东 湛江 524000

江西省林业科技推广和宣传教育中心,南昌 330033

蓝花楹 RAD-seq 遗传多样性 群体遗传

CAFYBB2019MB0042018KJCX024

2022

10.11926/jtsb.4517

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2022.30(5)
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