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向日葵AGO和DCL基因家族的鉴定和表达分析

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为了解向日葵(Helianthus annuus)的Argonaute(AGO)和Dicer-like(DCL)的功能,利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)的AGO和DCL基因序列在向日葵基因组数据库中进行同源比对,对向日葵AGO和DCL家族成员进行生物信息学分析.结果表明,从向日葵中鉴定到15 个HaAGOs和 5个HaDCLs家族成员;这2 类基因在染色体上的分布均不均匀.系统发育分析表明,与拟南芥相似,HaAGO家族成员可分为3个分支,HaDCL可分为4 个分支;所有的HaAGO都具有保守的N domain、DUF1785、PAZ和PIWI结构域,HaDCL家族成员都含有PAZ和RIBOc结构域.表达分析表明,HaDCL3a和HaDCL3b在茎和花序中高度表达;亚细胞定位表明HaAGO多定位于细胞核.这表明向日葵中可能存在典型的RNAi干扰机制,并可能参与了协调向日葵的生长发育过程.
Identification and Expression Analysis of AGO and DCL Gene Families in Sunflower

张红、员世宇、王文浩、刘文俊、何丽芬、闫玉星、王彦尊、王鹏冬、郑洪元、张鑫

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山西农业大学经济作物研究所,太原030031

省部共建有机旱作农业国家重点实验室(筹),太原 030031

RNA干扰 AGO家族 DCL家族 向日葵 基因表达

山西省重点研发计划国家特色油料产业技术体系项目山西农业大学生物育种工程项目山西省现代农业产业技术体系建设专项

201903D221088CARS-14-2-05YZGC0472022-05

2023

10.11926/jtsb.4612

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2023.31(3)
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