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菱叶绣线菊彩叶园艺品种'粉霜'和'黄金喷泉'的叶绿体基因组研究

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基于菱叶绣线菊(Spiraea×vanhouttei)培育出了很多的彩叶园艺品种,其中'粉霜'彩叶绣线菊('Pink Ice')和'黄金喷泉'菱叶绣线菊('Gold Fountain')是两个性状优良的品种,这两个彩叶品种的形成机制尚缺乏深入研究.该研究基于二代测序的浅层测序技术,对'粉霜'和'黄金喷泉'的叶绿体基因组进行组装、注释、绘制其叶绿体基因组图谱;结合网上已有的绣线菊属植物的叶绿体全基因组开展比较基因组学研究.结果表明,两个品种的叶绿体基因组均为典型的四分体结构,即含有 1 个LSC、1个SSC及2个IR;'粉霜'和'黄金喷泉'的叶绿体基因组大小分别为155 953和155 941 bp,各含有130个基因,包括85 个蛋白编码基因,37 个转运RNA基因和 8 个核糖体RNA基因;分别含有 67、69 个简单重复序列,其中,单核苷酸重复序列最多.筛选出这两个叶绿体基因组内 7 个高变异区域,分别为trnH_GUG-psbA、trnK_UUU、trnR_UCU-atpA、trnT_GCU-psbD、ndhC、rpl32、ycf1.菱叶绣线菊、'粉霜'和'黄金喷泉'虽有非常近缘的关系,但并未聚成单系.该研究首次获得了两种绣线菊属彩叶品种的叶绿体基因组,为进一步理解绣线菊属及其彩叶园艺品种的亲缘关系提供了大量有用信息,并为今后该属更多园艺资源的发掘奠定了基础.
Chloroplast Genome Analyses of Spiraea×vanhouttei'Pink Ice'and'Gold Fountain'

SpiraeaHorticultural varietyChloroplast genomePhylogenetic analysis

张巧玲、陈琳、张淑燕、颜海飞

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杭州西溪国家湿地公园生态文化研究中心,杭州 310013

华南农业大学生命科学学院,广州 510642

中国科学院华南植物园,广州 510650

绣线菊属 园艺品种 叶绿体基因组 系统发育分析

杭州西湖风景名胜区(市园文局、市运保委)科技发展计划

2018-006

2023

10.11926/jtsb.4769

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2023.31(4)
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