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湿地松木质部和针叶松脂合成基因分析

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为挖掘湿地松(Pinus elliottii)松脂合成相关的基因,对不同采脂期的木质部和针叶进行高通量转录组测序,与火炬松(Pinus taeda)参考基因组进行比对,共获得了68 211条unigenes,546 356 450条clean reads,平均比对率达90.21%.将不同时期木质部、木质部与针叶间进行两两对比,以P<0.05,|log2FoldChange|>1.0为标准来筛选差异基因,并进行GO和KEGG富集分析.结果表明,参与萜类物质合成的差异基因有133个,其中大部分富集在MEP途径,从差异基因中挑选8 个产脂相关的候选基因进行 RT-qPCR 验证,确定 HMGR、DXS、TPS、ABC 转运蛋白基因与产脂存在关联性.通过转录组测序与分析,挖掘出133个参与松脂萜类物质合成相关的差异基因,其中萜烯合酶基因(TPS)和ABC转运基因在正调控萜类物质合成中发挥关键作用.
Genes Related to Resin Biosynthesis in Xylem and Needle of Pinus elliottii

Pinus elliottiiResinTranscriptomeCandidate genes involved in resin biosynthesis

张文娟、谷振军、胡珊、张志红、李火根、杨春霞

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南京林业大学,林木遗传与生物技术教育部重点实验室,南方现代林业创新中心,南京 210037

江西省林业科学院林木遗传育种与栽培研究所,南昌 330032

峡江县林木良种场,江西 吉安 331409

湿地松 松脂 转录组 产脂候选基因

国家自然科学基金江西林业科学院青年科技人才培养项目Project for Distinguished Young Scholars of Jiangxi Academy of Forestry

32160389321603892021522901

2023

10.11926/jtsb.4691

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.627
ISSN：1005-3395
年,卷(期)：2023.31(4)
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