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蕨类植物叶绿体基因ycf94的分子进化研究

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ycf94基因是近年来在叶绿体基因组中新发现的一个基因,在蕨类植物中表现高度保守.该研究共选取94种蕨类植物,在系统发育背景下,对ycf94基因的结构特征、密码子偏好性、进化速率和适应性进化进行分析.结果表明,ycf94基因的密码子偏好性较弱,偏好使用以 A/U 结尾的密码子,且不同物种间的偏好性存在一定差异.密码子偏好性的形成主要受到突变压的影响,同时也存在其他因素的作用;基于凤尾蕨科和其他蕨类中ycf94基因的结构特征存在区别,对两者的分子替换速率进行了比较,表明颠换率、非同义替换率和ω值间存在显著差异;仅检测出 1 个正选择位点 74A,强烈的负选择作用表明ycf94基因的结构和功能基本趋于稳定.这为蕨类系统发育分析提供了新依据,并提供了解析ycf94基因功能的线索.
Molecular Evolution of Chloroplast Gene ycf94 in Ferns

Fernycf94 geneCodon usage biasEvolutionary rateAdaptive evolution

李子菲、苏应娟、王艇

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华南农业大学生命科学学院, 广州 510642

中山大学生命科学学院, 广州 510275

中山大学深圳研究院, 深圳 518057

蕨类植物 ycf94 密码子偏好性 进化速率 适应性进化

国家自然科学基金

31770587

2023

热带亚热带植物学报
中国科学院华南植物园,广东省植物学会

热带亚热带植物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.627
ISSN:1005-3395
年,卷(期):2023.31(4)
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