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兰科植物FNR基因的密码子偏好性分析

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为揭示兰科植物FNR基因的特性和密码子偏好性,采用DNAMAN、CodonW和SPSS软件及EMBOSS、SWISS-MODEL在线网站对17种兰科植物的FNR基因序列、氨基酸序列、同源区域及蛋白质三维结构进行分析.结果表明:兰科植物FNR基因普遍具有在A/T(U)与G/C之间较弱的密码子偏好性;密码子的末位在A和T(U)之间存在显著的T(U)偏好性,在C和G之间存在显著的C偏好性;NADP结合域比非结合域有较小的密码子偏好性;基于CDS和氨基酸聚类结果比基于RSCU聚类更接近于植物的进化分类;自然选择的作用是导致兰科植物FNR基因的密码子使用偏好性的主要成因.
Codon Usage Bias of Ferredoxin-NADP+ Oxidoreductase (FNR) in Orchidaceae

李蓉、谢析颖、王雪晶、苏立遥、林玉玲、郭容芳、陈裕坤、赖钟雄、徐涵

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福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州350002

法国图卢兹综合科学研究所,法国图卢兹313008

兰科 FNR基因 密码子偏好性

福建省重大科技专项闽江学者奖励计划项目

2015NZ0002-1MJJZ13-003

2018

热带作物学报
中国热带作物学会

热带作物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.807
ISSN：1000-2561
年,卷(期)：2018.39(6)
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