水产科学2008,Vol.27Issue(2) :59-63.

三疣梭子蟹Sox基因HMG盒的克隆分析

Cloning and Sequencing of Sox Gene HMG-box in Crab Portunus trituberculatus

沈建明 朱冬发 吴琼
水产科学2008,Vol.27Issue(2) :59-63.

三疣梭子蟹Sox基因HMG盒的克隆分析

Cloning and Sequencing of Sox Gene HMG-box in Crab Portunus trituberculatus

沈建明 1朱冬发 1吴琼1
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作者信息

  • 1. 宁波大学,教育部应用海洋生物技术重点实验室,浙江,宁波,315211
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摘要

利用能扩增人类SRY基因HMG盒的一对简并引物,分别对三疣梭子蟹雌雄个体基因组DNA进行扩增,均得到216 bp和约400 bp的两条带,不存在性别差异,通过PCR-SSCP分析,未发现雌蟹或雄蟹所特有的Sox基因.对216 bp的带进行克隆测序得到6个Sox基因,分别命名为PTSox21、PTSox12、PTSox11a、PTSox11b、PTSox11c和PTSox4.其中,PTSox21、PTSox12和PTSox4氨基酸序列与人类Sox21、Sox12和Sox4基因的同源性分别为90%、66%和63%,PTSox11a、PTSox11b和PTSox11c氨基酸序列均与人类Sox11基因有63%的同源性.此外,PTSox11a和PTSox11b的氨基酸序列之间的同源性达到了98.6%,只在第44位氨基酸残基不同.与其他物种Sox基因氨基酸序列的同源性比较发现,PTSox21与饰纹姬蛙Sox2a有92%的同源性,而PTSox12、PTSox11a、PTSox11b和PTSox11c均与意大利蜜蜂的Sox1有73%的同源性,PTSox4与意大利蜜蜂的Sox1有72%的同源性.

关键词

三疣梭子蟹/Sox基因/HMG盒/克隆分析

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基金项目

浙江省自然科学基金(Y305339)

宁波市自然科学基金(2007A610067)

出版年

2008
水产科学
辽宁省水产学会

水产科学

北大核心
影响因子:0.97
ISSN:1003-1111
被引量4
参考文献量4
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