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胃癌miRNAs预后风险评分模型的构建与应用

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目的 筛选与胃癌预后存在关联性的微小RNAs(miRNAs)生物标志物,构建风险评分模型用于患者预后评估.方法 基于人类癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库下载胃癌miRNAs表达谱数据及样本相关临床信息,通过"DESeq2"软件包对miRNAs表达谱进行差异分析.采用单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier生存分析筛选与预后存在关联性的miRNAs,并将预后miRNAs纳入多因素Cox回归分析用于预后风险评分模型的构建.通过"timeROC"软件包绘制受试者工作特征曲线(ROC),对模型效能进行评价.最后通过在线数据库对miRNAs可能结合的信使RNAs(mRNAs)进行预测,并通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)预测其功能.结果 以log2|Fold Change|>1,P<0.05为标准,筛选得到248个胃癌组织中差异表达的miRNAs.通过单因素Cox回归分析及Kaplan-Meier生存分析筛选到6个与患者总体生存率有关联性的差异表达的miRNAs,随后使用多因素Cox回归分析成功构建胃癌miRNAs预后风险评分模型,风险评分=0.04835×miR-181b-1+0.11206×miR-548d-1+0.06800×miR-675+0.07587×miR-708+1.17521×miR-4640+0.08989×miR-4709.Kaplan-Meier生存曲线结果显示,风险评分高的患者预后较差(P<0.001);模型5年总体生存率ROC曲线下面积(AUC)为0.776,证明该模型能够有效预测胃癌患者预后风险.GO和KEGG功能分析结果显示,模型miRNAs分子参与多个肿瘤相关代谢通路.结论 成功构建了miRNAs预后风险评分模型,且该模型对胃癌患者生存状态具有良好的预测效能.
Construction and application of a miRNAs prognostic risk assessment model of gastric cancer

史爽、李娟、米琦、王允山、杜鲁涛、王传新

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山东大学第二医院检验医学中心,山东 济南250033

山东省肿瘤标志物检测工程实验室,山东 济南250033

胃癌 miRNAs 预后 TCGA数据库 Cox风险评分模型

山东省重大科技创新工程项目山东大学基本科研业务费专项资金资助

2018YFJH05052018JC002

2020

山东大学学报(医学版)
山东大学

山东大学学报(医学版)

CSTPCD北大核心
影响因子：0.841
ISSN：1671-7554
年,卷(期)：2020.58(7)
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