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基于噬菌体展示和高通量测序的血清抗体整体质量评估体系研究

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目的·建立针对血清中抗体的整体质量评估体系,为血清自身抗体标志物相关研究提供量化的质控标准.方法·以50名健康者的血清为研究对象,分别经-80℃、-20℃、4℃、37℃、95℃处理后,与噬菌体随机肽展示库Ph.D.-12进行孵育,采用免疫沉淀方式获得噬菌体-IgG复合物.经高通量测序、生物信息学分析,统计每一种处理条件下血清结合肽的序列及频率,计算香农熵,评估血清中自身抗体的整体质量.结果·随着处理温度的升高,血清的香农熵逐渐降低;在同一温度条件下,血清的香农熵随着时间增长而逐渐降低,其中-20℃与-80℃处理的样品相比,香农熵波动不大;95℃处理10 min后的样品香农熵达到最低值.结论·联合噬菌体随机肽展示技术和高通量测序技术,可以用于解析血清中抗体的肽结合谱,并以香农熵为指征建立血清抗体整体质量评估体系.
Quality control of serum antibodies through the combination of phage display and next generation sequencing

赖丹昀、胡传圣、祁环、马明亮、李华、陶生策

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上海交通大学系统生物医学研究院,系统生物医学教育部重点实验室,上海200240

上海交通大学生物医学工程学院,上海200240

血清 质量控制 抗体 噬菌体展示 高通量测序 香农熵

国家重点研发计划国家自然科学基金国家自然科学基金国家自然科学基金

2016YFA0500600316708313137081331501054

2020

上海交通大学学报(医学版)
上海交通大学

上海交通大学学报(医学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.826
ISSN：1674-8115
年,卷(期)：2020.40(5)
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