基于高通量测序技术的北豆根转录组数据分析

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中文摘要：目的:分析北豆根转录组信息特征.方法:采用二代高通量测序技术对北豆根进行转录组测序,并进行系统的生物信息学分析.结果:转录组测序共得到37346个Unigene,平均长度986 nt,其中有20562个Unigene得到注释.采用微卫星识别工具(MISA)方法共鉴定出81种重复单元共9948个简单重复序列(SSRs).挖掘到21个Unigene参与北豆根活性成分的生物合成,涉及(S)-乌药碱N-甲基转移酶、多酚氧化酶、酪氨酸转氨酶、伯胺氧化酶、天冬氨酸转氨酶(细胞质)、天冬氨酸转氨酶(线粒体)、天冬氨酸转氨酶(叶绿体)和酪氨酸脱羧酶等8种酶基因.结论:揭示了参与北豆根活性成分生物合成的关键基因,为进一步研究活性成分代谢途径和调控机制奠定基础.

外文标题：Transcriptomic data analysis of Rhizoma menispermi based on high-throughput sequencing technology

作者：

杨宝

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作者单位：

山西省检验检测中心山西省标准计量技术研究院,山西太原030012

关键词：

北豆根蝙蝠葛转录组蝙蝠葛碱

基金：

山西省中药粉末饮片质量标准研究项目

项目编号：

2018016D

出版年：

2022

DOI：

10.19763/j.cnki.2096-7403.2022.04.10

山西中医药大学学报

ISSN：

年,卷(期)：2022.23(4)

参考文献量19