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基于转录组分析椰心叶甲啮小蜂复壮和保种种群差异表达基因

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为了明确椰心叶甲啮小蜂Tetrastichus brontispae响应种群退化的关键功能基因,通过对比其复壮和保种种群的转录组数据,对差异表达基因进行GO富集分析,并将差异基因在KEGG数据库中进行对比,获得显著性富集的通路注释信息.结果表明:相较于复壮种群,保种种群共有553个差异表达基因,其中206个基因上调表达,347个基因下调表达;这些差异基因显著富集在分子功能、细胞组分和生物过程三个大类中.分子功能中,富集到单氧酶活动的差异基因数量最多,占供试基因总数的28.57%;细胞膜富集到细胞组分中的差异基因最多,占供试基因总数的68%;而富集在生物过程中各项的差异基因都较少,仅有1~2个.差异基因主要在Hh信号通路、Hh信号通路-fly、胰腺分泌和神经活性配体受体相互作用4条通路中显著富集.椰心叶甲啮小蜂复壮和保种种群的差异基因涉及到蜂王浆主蛋白、嗅觉蛋白、细胞色素P450等,与椰心叶甲啮小蜂的个体发育、求偶交配以及产卵过程密切相关,可为进一步探究椰心叶甲啮小蜂种群退化的分子机制奠定理论基础.
Analysis of differentially expressed genes in rejuvenated and conserved populations of Tetrastichus brontispae based on transcriptome sequencing

刘华伟、李朝绪、李芬、吕朝军、吴少英、覃伟权

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中国热带农业科学院椰子研究所,海南省院士团队创新中心,海南省热带油料作物生物学重点实验室,海南 文昌 571399

海南大学热带作物学院,海南 海口 570228

海南大学植物保护学院,海南 海口 570228

椰心叶甲啮小蜂 椰心叶甲 转录组 差异表达基因 退化

ZDKJ2018171630152017010KYQD-2R-1963KYQD-ZR-1951

2021

中国森林病虫
国家林业局森林病虫害防治总站

中国森林病虫

CSTPCD
影响因子:0.593
ISSN:1671-0886
年,卷(期):2021.40(5)
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