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北京地区肉类中沙门氏菌全基因组分型及耐药分析

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目的 对我国北京地区肉类产品中沙门氏菌进行分离鉴定,基于全基因组测序结果,分析其耐药基因分布情况及亲缘关系.方法 以38株沙门氏菌为研究对象,对不同来源的沙门氏菌进行全基因组分析,然后通过测定菌株对15种抗生素的最小抑菌浓度,结合全基因组测序结果分析不同来源的沙门氏菌的耐药特性及多重耐药状况.结果 对38株沙门氏菌进行15种抗生素耐药性检测,其中34.2%为多重耐药株,68.4%的沙门氏菌对喹诺酮萘啶酸耐药,42.1%分离株对氨苄西林耐药.基于全基因组测序结果,对38株沙门氏菌进行分型为12种型别,其中88.2%的肠炎沙门氏菌与标准菌株ATCC9184亲缘关系较近.结论 全基因组耐药基因和毒力基因与耐药表型有一定的关联,为监控北京地区的沙门氏菌耐药基因和毒力基因的传播方式提供理论基础.
Genotyping and drug resistance analysis of Salmonella in meat in Beijing

畅晓晖、张捷、亓合媛、石嵩、杨向莹、杨磊、赵琢、李小林、史文聿、孙清岚、马俊才、陈广全

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北京海关技术中心, 北京 100026

中国科学院微生物研究所, 北京 100101

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沙门氏菌 全基因组测序 耐药基因 耐药表型

国家重点研发计划重点专项海关总署科技计划项目

2018YFC16038002017IK157

2020

食品安全质量检测学报
北京市电子产品质量检测中心 北京方略信息科技有限公司

食品安全质量检测学报

CSTPCD北大核心
影响因子:0.73
ISSN:2095-0381
年,卷(期):2020.11(3)
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