基于高通量测序技术分析青藏高原牦牛和犏牛乳中微生物多样性的研究

Study on Microbial Diversity in Milk of Yak and Cattle-Yak in Qinghai-Tibet Plateau Based on High-throughput Sequencing Technology

马静 ¹张琳琳 ¹柴沙驼 ¹王迅 ¹崔占鸿 ¹孙璐 ¹刘书杰¹

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作者信息

1. 青海大学畜牧兽医科学院,青海西宁 810016;青海高原牦牛研究中心,青海西宁 810016;青海省高原放牧家畜动物营养与饲料科学重点实验室,青海西宁 810016
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摘要

为探究牦牛和犏牛生鲜乳中微生物的组成和多样性,采用高通量测序技术分析两种生鲜乳的16S rDNA V4区域,并进行生物信息学对比分析.结果显示:97％的一致性共得到5516个OTUs,微生物门水平的比较表明变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)及放线菌门(Actinobacteria)为牦牛乳和犏牛乳共同的优势菌门,牦牛乳三种微生物的相对丰度分别为29.80％、35.99％及8.41％,犏牛乳为45.36％、25.79％及7.39％;在属水平上,牦牛乳的优势菌属为未分类的蓝藻细菌属(unidentified-Cyanobacteria),相对丰度为9.32％,犏牛乳的优势菌属为慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium),所占比例为11.53％;在种水平上,埃尔坎尼中慢生根瘤菌种(Bradyrhizobium elkanii)和Kosakonia oryzae为牦牛乳和犏牛乳中共有的优势菌种,两种菌种在牦牛乳中分别占比2.42％、3.36％,在犏牛乳中分别占比11.53％、5.53％;Alpha多样性分析表明不同牛乳丰度估计值存在显著差异(P<0.05),且犏牛乳的丰富度及多样性较高.

关键词

牦牛乳/犏牛乳/微生物多样性/16S/rDNA

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基金项目

青海省重点实验室专项(2013-Z-Y03)

青海省牛产业科技创新平台()

出版年

2021

食品工业科技

北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心

影响因子：0.842

ISSN：1002-0306

被引量8

参考文献量10

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