摘要
目的:基于网络药理学方法探讨咖啡酰奎宁酸类化合物抑菌的作用机制.方法:通过文献挖掘和数据库检索获取咖啡酰奎宁酸类化合物对应靶点、抑菌相关靶点及两者交集靶点,将交集靶点构建蛋白互作(protein-protein interaction network,PPI)网络,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)分析.结果:咖啡酰奎宁酸类化合物对应靶点483个,抑菌相关靶点805个,咖啡酰奎宁酸类化合物抑菌作用靶点75个,起关键作用的为TNF、AKT1、ALB、MMP9、EGFR、MAPK8等靶点.GO功能分析及KEGG通路富集分析结果显示,咖啡酰奎宁酸类化合物抑菌的作用机制主要涉及应激反应、代谢过程、生物调节、多细胞生物过程、细胞讯息传递等生物过程,并通过细胞外基质组织、胶原蛋白降解、基质金属蛋白酶的激活和神经生长因子信号通路等多条通路共同发挥作用.化合物与分子靶点对接结果良好,验证了网络构建预测的准确性.结论:本研究揭示了咖啡酰奎宁酸类化合物抑菌具有多靶点、多途径的特点,为其分子机制的进一步研究奠定了基础.
基金项目
山东省自然科学基金(ZR2019BC100)
农业农村部蔬菜产后处理重点实验室开放课题()
泰山产业领军人才工程高效生态农业创新类计划(LJNY201705)
山东省重点扶持区域引进急需紧缺人才项目()
山东省重大科技创新工程项目(2019JZZY011020)
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