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利用转录组学分析三峡肽素生物合成的基因簇

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为了分析三峡肽素(Sanxiapeptin)生物合成途径,本文采用BGISEQ-500平台测定了SG-4在200 mL培养4、7 d及300 mL培养7 d时cDNA文库,并对高通量测序产生的6.42 Gb序列数据进行了无参转录组分析.结果表明,转录组序列比对率高达93.88％,差异基因主要集中在抗生素合成、物质转运及氧化还原代谢等途径,在非核糖体肽合成酶(NRPS,Non-ribosomal peptide synthetase)基因簇PDE_01071中,21个基因的表达趋势与物质的含量完全吻合,暗示其可能参与了三峡肽素的合成.
Analysis of Gene Clusters for Sanxiapeptin Biosynthesis by Transcriptomic Sequencing

刘超、李坤、白晓轩、杨宇纯、薛艳红、刘士平

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三峡大学生物与制药学院,中国轻工业功能酵母重点实验室,湖北宜昌 443002

草酸青霉 三峡肽素 柑橘 生物合成 转录组 基因簇

国家自然科学基金国家自然科学基金

3127038931540065

2021

10.13386/j.issn1002-0306.2020110192

食品工业科技
北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心
影响因子：0.842
ISSN：1002-0306
年,卷(期)：2021.42(13)
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