利用转录组学分析三峡肽素生物合成的基因簇

Analysis of Gene Clusters for Sanxiapeptin Biosynthesis by Transcriptomic Sequencing

刘超 ¹李坤 ¹白晓轩 ¹杨宇纯 ¹薛艳红 ¹刘士平¹

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作者信息

1. 三峡大学生物与制药学院,中国轻工业功能酵母重点实验室,湖北宜昌 443002
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摘要

为了分析三峡肽素(Sanxiapeptin)生物合成途径,本文采用BGISEQ-500平台测定了SG-4在200 mL培养4、7 d及300 mL培养7 d时cDNA文库,并对高通量测序产生的6.42 Gb序列数据进行了无参转录组分析.结果表明,转录组序列比对率高达93.88％,差异基因主要集中在抗生素合成、物质转运及氧化还原代谢等途径,在非核糖体肽合成酶(NRPS,Non-ribosomal peptide synthetase)基因簇PDE_01071中,21个基因的表达趋势与物质的含量完全吻合,暗示其可能参与了三峡肽素的合成.

关键词

草酸青霉/三峡肽素/柑橘/生物合成/转录组/基因簇

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基金项目

国家自然科学基金(31270389)

国家自然科学基金(31540065)

出版年

2021

食品工业科技

北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心

影响因子：0.842

ISSN：1002-0306

被引量2

参考文献量8

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