食品工业科技2022,Vol.43Issue(20) :29-38.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2022010078

基于分子对接技术研究鱼源抗冻多肽与鱼肌球蛋白的相互作用

Prediction of Interaction between Fish-derived Antifreeze Peptides and Fish Myosin by Molecular Docking

江文婷 陈旭 蔡茜茜 杨傅佳 黄丹 黄建联 汪少芸
食品工业科技2022,Vol.43Issue(20) :29-38.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2022010078

基于分子对接技术研究鱼源抗冻多肽与鱼肌球蛋白的相互作用

Prediction of Interaction between Fish-derived Antifreeze Peptides and Fish Myosin by Molecular Docking

江文婷 1陈旭 2蔡茜茜 2杨傅佳 2黄丹 3黄建联 3汪少芸2
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作者信息

  • 1. 福州大学生物科学与工程学院,福建福州 350108;福建省冷冻调理水产品加工重点实验室,福建厦门 361022
  • 2. 福州大学生物科学与工程学院,福建福州 350108
  • 3. 福建省冷冻调理水产品加工重点实验室,福建厦门 361022;福建安井食品集团股份有限公司,福建厦门 361022
  • 折叠

摘要

冻藏期间蛋白质冷冻变性是引起解冻后鱼糜凝胶化能力下降的主要原因之一,而肌球蛋白重链(Myosin Heavy Chain,MHC)是鱼糜凝胶形成的主要贡献者.本研究使用不同生物酶酶解制备抗冻多肽,通过计算机模拟酶解技术筛选抗冻多肽.利用蛋白质同源建模构建海鲈鱼肌球蛋白空间结构,通过分子对接和分子动力学模拟解析抗冻多肽与海鲈鱼肌球蛋白重链的作用位点及可能的作用机制.结果表明,胰蛋白酶酶解物具有高抗冻活性,对菌体低温胁迫保护达到80.35%±4.39%,并具有良好的热滞活性及抑制重结晶作用.模拟胰蛋白酶酶解获得的肽段GPR与GPAGGK可以与肌球蛋白重链通过分子间作用力结合,其中GPAGGK的结合更为稳定.这种相互作用可以阻碍肌球蛋白在温度变化中的结构改变,其机理可能是抗冻多肽结合在肌球蛋白重链的结构空腔上,影响了结合水解离后引起的疏水键及二硫键等化学键的形成,阻碍蛋白侧链聚集、结构改变和冰晶的位移等,这有利于鱼糜及鱼糜制品在冷冻贮藏中的品质保持.本研究结果为抗冻多肽应用于鱼糜及其制品在冷冻贮藏过程中品质保持的应用提供科学依据.

关键词

分子模拟/计算机模拟酶解/虚拟筛选/抗冻多肽/肌球蛋白

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基金项目

出版年

2022
食品工业科技
北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心
影响因子:0.842
ISSN:1002-0306
被引量1
参考文献量9
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