首页|基于高通量测序与培养基鉴定法分析不同省份不同养殖模式下小龙虾菌群的多样性

基于高通量测序与培养基鉴定法分析不同省份不同养殖模式下小龙虾菌群的多样性

Analysis of Microbial Diversity of Crayfish under Different Culture Modes in Different Provinces Based on High-throughput Sequencing and Traditional Culture Methods

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 维普
  • 万方数据
本研究以安徽霍邱、江苏盱眙、湖北荆州三地的小龙虾作为研究对象,在荆州另取稻虾互作和养殖塘两种模式的环境样本.利用高通量技术做菌相分析,利用培养基鉴定法进行分离纯化鉴定,验证优势菌种类和数量.结果表明:荆州两组小龙虾初始菌数略低于盱眙和霍邱小龙虾,选择培养基上差别较小.高通量测序结果表明,科水平上三地小龙虾的优势菌主要为气单胞菌科和肠杆菌科;稻虾塘土壤菌群丰度远高于养殖塘,水体菌群较相似.属水平上,荆州稻虾塘、养殖塘、盱眙和霍邱四组小龙虾样本菌群丰度存在差异,但气单胞菌属和不动杆菌属都占较高比例,依次为41.8％、1.8％,12.4％、11.4％,24.5％、27.5％,40.1％,13.0％.荆州稻虾塘小龙虾优势菌还包括乳球菌属和柠檬酸杆菌属,养殖塘样本存在哈夫尼亚菌属和乳球菌属,盱眙与霍邱小龙虾样本优势菌均有微小杆菌属和柠檬酸杆菌属.培养基结果表明三地小龙虾优势菌均主要为气单胞菌属、哈夫尼亚菌属和柠檬酸杆菌属,与高通量结果相符.

范鹏飞、冯武、肖瑶、张月洁、杜红英、陈加平

展开 >

华中农业大学食品科学与技术学院,湖北武汉 430070

高通量测序 小龙虾菌群 优势菌种 环境菌群 稻虾共作

国家重点研发计划

2019YFC1606003

2023

10.13386/j.issn1002-0306.2022030245

食品工业科技
北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心
影响因子：0.842
ISSN：1002-0306
年,卷(期)：2023.44(1)
  • 1
  • 18