食品工业科技2023,Vol.44Issue(11) :153-162.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2022080109

鼠李糖乳杆菌L-乳酸脱氢酶的生物信息学分析和基因克隆

Bioinformatics Analysis and Gene Cloning of L-Lactate Dehydrogenase from Lactobacillus rhamnosus

许黎明 蒋国凤 伍新龄 廖秀芳 劳夏姐 牙韩春 李秀年
食品工业科技2023,Vol.44Issue(11) :153-162.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2022080109

鼠李糖乳杆菌L-乳酸脱氢酶的生物信息学分析和基因克隆

Bioinformatics Analysis and Gene Cloning of L-Lactate Dehydrogenase from Lactobacillus rhamnosus

许黎明 1蒋国凤 2伍新龄 1廖秀芳 1劳夏姐 1牙韩春 1李秀年1
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作者信息

  • 1. 广西工业职业技术学院医药健康学院,壮瑶医药药用生物产业技术工程研究中心,壮瑶医药药用植物园,大健康协同创新中心,广西南宁 530001
  • 2. 广西大学林学院,广西森林生态与保育重点实验室,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西南宁 530004
  • 折叠

摘要

本研究以鼠李糖乳杆菌(Lactobacillus rhamnosus)L-乳酸脱氢酶(Lr-L-LDH)为研究对象,以研究较多的Lr-L-LDH1为对照,对基因组注释的两个Lr-L-LDH1和Lr-L-LDH2基因,进行异同分析.采用在线网站和专业软件对Lr-L-LDH1和Lr-L-LDH2的一级结构、基本特性、亲疏水性、二级结构进行分析和预测,对三级结构进行同源建模以及酶和底物的分子对接分析,并对酶的编码基因进行系统发育分析,克隆表达及酶活性检测.结果显示:相较于Lr-L-LDH1,Lr-L-LDH2有着相似的分子特性,二级和三级结构,但Lr-L-LDH2编码序列短,氨基酸序列同源性低(48.08%),有不同的进化地位;Lr-L-LDH2也含有乳酸脱氢酶催化活性位点序列和保守的NAD+结合位点序列(GXGXXG),能够形成典型的活性三维口袋域,是NAD+依赖型四聚体结构L-乳酸脱氢酶,在细胞中需要果糖 1,6-二磷酸(FBP)来激活,催化丙酮酸还原为L-乳酸;体外克隆表达和酶学分析表明,Lr-L-LDH2酶活力极显著低于Lr-L-LDH1(P<0.01).Lr-L-LDH1和Lr-L-LDH2都具有乳酸脱氢酶活性,推测二者在乳酸表达调控中相互作用,对鼠李糖乳杆菌L-乳酸脱氢酶的分子改造应同时考虑Lr-L-LDH1和Lr-L-LDH2的作用,研究对乳酸发酵工业的基因工程改造提供分子基础和科学依据.

关键词

鼠李糖乳杆菌/L-乳酸脱氢酶/生物信息学/进化分析/活性位点/酶活力

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基金项目

广西科技计划重点研发项目(桂科AB17292001)

广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2023KY1314)

广西工业职业技术学院科研基金(GYKY2022001A)

出版年

2023
食品工业科技
北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心
影响因子:0.842
ISSN:1002-0306
被引量1
参考文献量13
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