食品工业科技2023,Vol.44Issue(23) :11-20.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2023010103

基于网络药理学与分子对接探讨兰州软儿梨止咳化痰作用机制

Based on Network Pharmacology and Molecular Docking to Discuss the Mechanism of Antitussive and Expectorant Action of Ruanerli

罗慧英 吴步梅 马天玥 张文利 方彩霞 魏永波 陈辅斌
食品工业科技2023,Vol.44Issue(23) :11-20.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2023010103

基于网络药理学与分子对接探讨兰州软儿梨止咳化痰作用机制

Based on Network Pharmacology and Molecular Docking to Discuss the Mechanism of Antitussive and Expectorant Action of Ruanerli

罗慧英 1吴步梅 2马天玥 3张文利 2方彩霞 2魏永波 4陈辅斌5
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作者信息

  • 1. 甘肃中医药大学药学院,甘肃兰州 730000;甘肃省中药药理与毒理学重点实验室,甘肃兰州 730000
  • 2. 兰州市农业科技研究推广中心,甘肃兰州 730000
  • 3. 中国药科大学生命科学与技术学院,江苏南京 211198
  • 4. 皋兰百璐通瓜果专业合作社,甘肃兰州 730200
  • 5. 什川镇农业农村综合服务中心,甘肃兰州 730200
  • 折叠

摘要

采用网络药理学方法预测软儿梨止咳化痰作用及其机制,并采用分子对接和动物实验对预测结果予以验证.通过文献调研和 TCMSP等数据库筛选得到软儿梨的成分与作用靶点,与 GeneCards数据库中"咳嗽(cough)"和"痰(sputum)"相关的两组基因相映射,得到软儿梨止咳化痰作用的靶点基因.通过Metascape平台对靶点基因进行GO和KEGG富集分析;通过STRING数据平台构建靶点基因间PPI网络;利用Cytoscape插件CytoHubba筛选软儿梨止咳化痰作用Top10基因,并通过Metascape数据平台对Top10基因进行KEGG通路富集以预测软儿梨止咳化痰作用可能涉及的信号通路.通过Autodock Vina对预测所得Top10基因蛋白和软儿梨Top3活性成分进行分子对接;最后通过氨水引咳试验和酚红排泄试验对预测所得结果进行验证.经多数据库联合分析,发现软儿梨中已见报道的化学成分有 51个,对应作用靶点 282个,其中 80个与止咳化痰作用有关,根据Degree值筛选出的Top10基因主要富集在与感染和免疫相关通路上.分子对接试验证明Top10基因与PPI网络中排名前 3位的化学成分(咖啡酸、芦丁、戊醛)有较强的结合活性.动物实验证明软儿梨可以明显抑制小鼠氨水引发的咳嗽反应,降低血清中IL-6和IL-13水平,增加小鼠气管酚红的排泄量.PCR和WB检测发现,软儿梨可降低炎症相关基因IL6、IL1B、VEGFA、PTGS2、MAPK3的mRNA水平和蛋白表达,软儿梨的止咳化痰作用可能与降低炎性基因表达,减少致炎因子释放有关.

关键词

网络药理学/分子对接/软儿梨/止咳化痰/炎症因子

Key words

network pharmacology/molecular docking/Ruanerli/antitussive and expectorant effects/inflammatory factor

引用本文复制引用

基金项目

甘肃省农业农村厅项目(20221809RB)

出版年

2023
食品工业科技
北京一轻研究院

食品工业科技

CSTPCD北大核心
影响因子:0.842
ISSN:1002-0306
被引量2
参考文献量13
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