以六堡茶陈化初期不同时间段茶叶样品为研究对象,应用Miseq测序技术直接从茶叶样品中提取真菌基因组DNA并进行扩增测序,最后进行生物信息统计分析,揭示六堡茶陈化初期不同时间段样品中真菌多样性.六堡茶4个不同陈化初期样品在97%的相似性水平下分类出62个OUT,门3,纲6,目9,科8,属9.在属水平上,4个样品真菌以曲霉属、散囊菌属为主,并检测出其他黑茶未检出的真菌群落,分别为:Coprinellus、Cystolepiota、Gymnoascus、Thielavia.陈化初期不同阶段真菌群落存在差异,随着陈化进行,真菌多样性降低.