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基于高通量测序分析进口大麦真菌多样性

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文章介绍了高通量测序技术在食品安全及植物病害真菌检疫中的应用.利用Illumina-Hiseq测序技术,对进口和国产大麦的真菌多样性进行了研究.从澳大利亚、法国、加拿大和国产大麦样品中共获得331054个ITS序列,系统分类学分析将其归类为6门、25纲、50目、80科、115属、158种,表明样品的真菌多样性较高.进口大麦和国产大麦的优势真菌均以子囊菌门Ascomycota和担子菌门Basidiomycota为主,两者之和占到全部真菌的97.46%~99.97%;优势菌属为李维菌属Lewia、隐球菌属Cryptococcus、Udeniomyces菌属、埃里格孢属Embellisia、锁掷酵母属Sporidiobolus、赤霉属Gibberella、蜡蚧菌属Lecanicillium、链格孢属Alternaria、红酵母属Rhodotorala、曲霉属Aspergillus、格孢腔菌属Pleospora等.韦恩图分析结果显示法国、加拿大、澳大利亚和中国的大麦真菌群落种类差异较大,每个产地的大麦真菌群落有各自的特性真菌.文章利用高通量测序建立了进口和国产大麦真菌多样性生物信息学数据库,不仅能够指导以大麦为原料的食品工业的安全生产、产品质量保障,也为进出口大麦的生物安全监测预警、风险防范及管控提供了科学的数据支持.
Analyzing Fungal Diversity in Imported Barley Using High-Throughput Sequencing

杨爱馥、姜红旭、孙赟、梁冰、崔博采、郑秋月、姚丽锋、姜丽

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大连海关,辽宁大连116001

大连民族大学,辽宁大连116600

拱北海关,广东珠海519020

大麦 高通量测序 真菌多样性

海关总署科研项目大连海关科研项目科技部国家重点研发计划(十三五)辽宁省自然科学基金

2021HK1862021DK102017YFC1600803-320180551271

2022

食品科技
北京市粮食科学研究所

食品科技

CSTPCD北大核心
影响因子:0.622
ISSN:1005-9989
年,卷(期):2022.47(11)
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