食品科学2021,Vol.42Issue(4) :278-286.

基于DNA条形码技术鉴别有毒鹅膏菌属物种

DNA Barcoding for Identification of Toxic Amanita Species

白文明 邢冉冉 陈丽萍 彭涛 雷红涛 陈颖
食品科学2021,Vol.42Issue(4) :278-286.

基于DNA条形码技术鉴别有毒鹅膏菌属物种

DNA Barcoding for Identification of Toxic Amanita Species

白文明 1邢冉冉 2陈丽萍 3彭涛 2雷红涛 4陈颖2
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作者信息

  • 1. 华南农业大学食品学院,广东广州 510642;中国检验检疫科学研究院,北京 100176
  • 2. 中国检验检疫科学研究院,北京 100176
  • 3. 中华人民共和国昆明海关检验检疫技术中心,云南昆明 650051
  • 4. 华南农业大学食品学院,广东广州 510642
  • 折叠

摘要

收集27个鹅膏菌属物种共38份样本,提取样品基因组DNA,应用通用引物扩增其内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)、核糖体大亚基(large ribosomal subunit,LSU)、RNA聚合酶的第二大亚基(the second largest subunit of RNA polymerase II,RPB2)、β-微管蛋白(β-tubulin)基因序列并进行Sanger双向测序,将得到的序列进行校对拼接后与NCBI的GenBank数据库中的参考序列进行比对鉴别物种来源;计算物种的种内、种间Kimura-2-Parameter(K2P)遗传距离并构建系统发育树.结果表明,β-tubulin、ITS基因序列鉴别能力优于RPB2、LSU基因序列,可将β-tubulin与ITS两者联合用于鹅膏菌属的物种鉴别,为有毒蘑菇诱发的食源性中毒风险进行预警.β-tubulin基因序列长度较LSU、ITS、RPB2等基因序列短,适合对深加工的蘑菇制品以及误食毒蘑菇后的呕吐物进行分析,可作为鹅膏菌属中毒事件中物种鉴定及溯源的优选条形码.

关键词

鹅膏菌属/DNA条形码/物种鉴别

引用本文复制引用

基金项目

"十三五"国家重点研发计划重点专项(2017YFF0211301)

出版年

2021
食品科学
北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.327
ISSN:1002-6630
被引量6
参考文献量15
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