摘要
基于培养基显著影响蛹虫草类胡萝卜素的生成,采用高通量测序技术探究不同培养基培养的蛹虫草菌丝(CM10_RL和CM10_WL)的转录组差异,经生物信息学分析挖掘蛹虫草类胡萝卜素的生物合成相关基因.结果 表明,样品CM10_WL的类胡萝卜素含量显著高于样品CM10_RL的类胡萝卜素含量;相对于样品CM10_RL,在样品CM10_WL中检测到318个上调表达基因和618个下调表达基因.基因本体论功能富集结果表明差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)主要富集在代谢过程、细胞膜、催化活性条目中.京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集结果表明DEG主要富集在代谢途径.蛹虫草转录本与KEGG数据库中的类胡萝卜素生物合成途径比对结果表明基因CCM_06728和CCM_09155参与类胡萝卜素的生物合成.本研究为进一步阐明蛹虫草类胡萝卜素的生物合成途径奠定基础.
基金项目
广东省重点领域研发计划项目(2018B020205001)
广东省重点领域研发计划项目(2018B020205003)
广东省现代农业食用菌产业技术体系项目(2019KJ103)
国家自然科学基金面上项目(31772373)
国家自然科学基金面上项目(31572178)
河南工业大学高层次人才科研基金(2020BS001)
国家自然科学基金-河南省联合基金重点项目(U1604234)
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